對(duì)真菌細(xì)胞進(jìn)行破壁,，提取其DNA。

實(shí)驗(yàn)原理

隨著分子生物學(xué)技術(shù)的進(jìn)展,，PCR相關(guān)方法越來越多地被應(yīng)用到真菌學(xué)研究中來,，而真菌DNA的提取是包括分子診斷在內(nèi)的所有實(shí)驗(yàn)的基礎(chǔ),，簡便快捷地提取真菌DNA，且獲得的DNA完整、純度高,，對(duì)真菌分子生物學(xué)的研究有及其重要的意義,。

真菌細(xì)胞壁以幾丁質(zhì)、葡萄糖為主構(gòu)成細(xì)胞壁骨架,，而基質(zhì)則由多糖,、甘露聚糖、糖蛋白,、脂質(zhì)等填充,。絲狀真菌堅(jiān)韌厚壁的構(gòu)成，需要較為繁瑣的破壁手段,，故真菌DNA的提取較細(xì)菌或其他組織細(xì)胞難度更大,。為保證真菌PCR技術(shù)及其相關(guān)分子生物學(xué)技術(shù)的順利開展，簡便快捷地提取真菌DNA,，且獲得的DNA完整,、純度高，是必須解決的前提條件,。

實(shí)驗(yàn)材料和器具

樣品：真菌類

儀器：高通量組織研磨儀（上海凈信,，Tissuelyser-48）

耗材：離心管（上海凈信，0.4研磨單位）,，研磨珠（上海凈信,，6號(hào)，1顆）

試劑：TE Buffer,，DA Buffer,，E Binding Buffer，Elution Buffer

實(shí)驗(yàn)步驟

方法1

1.1 取0.1g菌絲加入0.4研磨單位離心管中,，加0.08mlTE Buffer,，加入石英砂100mg；

1.2 將離心管放入上海凈信科技的高通量組織研磨儀Tissuelyser-48中,，設(shè)置頻率13單位振頻,，研磨10min；

1.3 取出離心管于65°C環(huán)境中溫浴30min,，然后移出,；

1.4 加入0.65mlDA Buffer，混合均勻后于冰浴中放置5min,；

1.5 放入離心機(jī)14000r/min離心3min,；

1.6 將上清液轉(zhuǎn)移到一個(gè)新的0.5研磨單位離心管中，加0.15ml的E Binding Buffer,，并混合均勻,，將混合液體轉(zhuǎn)移至Spin column,；

1.7 放入離心機(jī)6000r/min離心1min，棄去接液管中液體,；

1.8 Spin column中加入0.12ml的Wash Buffer,，于10000r/min離心30s，棄去接液管中液體,；

1.9 重復(fù)步驟1.8,，棄去接液管中液體后，再10000r/min離心60s,，Spin column轉(zhuǎn)到新的EP管中,；

1.10 Spin column中加入0.03ml Elution Buffer，室溫放置1min,。12000 r/min離心60s,，并棄去Spin column。

方法2

2.1 取0.1g菌絲加入0.4研磨單位離心管中,，加0.08ml10×TE Buffer，加入石英砂100mg,；

2.2 將離心管放入上海凈信科技的高通量組織研磨儀Tissuelyser-48中,，設(shè)置頻率60hz，研磨2-3min,；

2.3 加入0.024ml10%SDS,，加入0.002ml蛋白酶K，混勻,，65°C環(huán)境中水浴30min,；

2.4 然后渦旋1min，加入0.024ml5M NaCl,，加入1/10體積的10%CTAB（約0.013ml）,；2.5 于65°C水浴60min，渦旋1min,；

2.6 抽提,，加入1/2體積（約0.07mi）的Tris飽和酚及1/2體積（約0.07ml）的氯仿：異戊醇（24:1），混勻,；

2.7 于離心機(jī)14000轉(zhuǎn)離心1min,，取上清液到另一離心管中；

2.8 重復(fù)步驟2.7 2-3次（視兩相界面雜質(zhì)多少而定）,。

2.9 加入等體積氯仿：異戊醇（24:1）混勻,，14000轉(zhuǎn)離心10min，取上清液至另一離心管中,；

2.10 后開始沉淀,，加入0.045ml NH4Ac,，輕柔混勻，冰水中放置30min,，加入0.6倍體積的異丙醇,，混勻，14000轉(zhuǎn)離心10min,，棄上清液,；

2.11 用1000ul70%乙醇清洗沉淀，室溫晾干,，加0.04ml TE Buffer溶解沉淀,。